初次沉淀池的运行管理应注意以下方面:
①操作人员根据池组设置、进水量的变化，应调节各池进水量，使各池均匀配水；通过调节配水井上各池进水闸阀的开启度，使并联运行的数个沉淀池水量均匀，负荷相等，停留时间一致，从而提高沉淀效率。
②初次沉淀池应及时排泥，并宜间歇进行；机械排泥可连续排放，也可间歇排放。为保证排放污泥的含水率小于 97% ，采用间歌排泥效果较好。排泥时，应注意用污泥浓度计或界面计等仪器测试，从而控制排放污泥的浓度。此外，还应根据进水水温、水质的变化调整排泥间歇时间，夏季适当缩短。
③操作人员应经常检查初次沉淀池浮渣斗和排渣管道的排渣情况，并及时清除浮渣。清捞出的浮查应妥善处理；浮渣是污水中较轻的漂浮物，刮至排渣斗中，如冲洗水不足，可能造成排渣斗或管道的堵塞。此时，操作人员应及时疏通排渣管或用人工清捞浮渣，避免池面漂浮大量的浮渣。否则既影响出水效果，又会引来大批水鸟捕食，使刮泥设备和池面鸟类成灾，给操作人员的清理工作带来很大的麻烦。集中到浮渣池的浮捞出后，不得随意堆置，应与栅渣、沉沙池的浮渣一并处理。
④刮泥机待修或长期停机时，应将池内污泥放空；刮泥机或池体结构需检修改造，刮泥设备长时间停止运转时，如沉淀池只放水，池内污泥不排除将造成池底污泥板结。当刮泥机再启动时，阻力大，严重时甚至会损坏设备。
⑤采用泵房排泥工艺时，可按有关规定执行；
⑥当剩余活性污泥排入初次沉淀池时，在正常运转情况下，应控制其回流比小于 2%。如果剩余活性污泥不进行单独浓缩，而回流到初次沉淀池与生污泥产生絮凝沉淀，不仅使污泥浓缩性能好，沉淀效率高，而且还省去了浓缩池的基建费和运行管理费。